При возвращении на линукс встал вопрос: как не потерять сотни писем и при этом не синхронизировать 2 разных профиля с письмами.
Проблема решилась редактированием файла ~/.mozilla-thunderbird/profles.ini
Был указан путь к примонтированному каталогу Documents and Settings в разделе с Windows
[General]
StartWithLastProfile=1
[Profile0]
Name=1
IsRelative=0
Path=/media/*/Documents and Settings/*/Application Data/Thunderbird/Profiles/*.default
Default=1
В результате в любой из 2-х систем имеем один и тот же набор "ящиков" ;)